MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785S

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012552	AAAGG	2	10	28	37	60 %	0 %	40 %	0 %	226526992
2	NC_012552	ATCA	2	8	48	55	50 %	25 %	0 %	25 %	226526992
3	NC_012552	AAT	2	6	61	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226526992
4	NC_012552	GAAT	2	8	81	88	50 %	25 %	25 %	0 %	226526992
5	NC_012552	TTG	2	6	151	156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
6	NC_012552	ATT	3	9	251	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226526992
7	NC_012552	A	7	7	379	385	100 %	0 %	0 %	0 %	226526992
8	NC_012552	TGT	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
9	NC_012552	AGA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526992
10	NC_012552	A	7	7	588	594	100 %	0 %	0 %	0 %	226526992
11	NC_012552	TGA	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526992
12	NC_012552	GA	3	6	673	678	50 %	0 %	50 %	0 %	226526992
13	NC_012552	TCA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226526992
14	NC_012552	GA	3	6	734	739	50 %	0 %	50 %	0 %	226526992
15	NC_012552	A	6	6	758	763	100 %	0 %	0 %	0 %	226526992
16	NC_012552	TTG	2	6	781	786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
17	NC_012552	GTT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
18	NC_012552	CAAA	2	8	857	864	75 %	0 %	0 %	25 %	226526992
19	NC_012552	GAAA	2	8	888	895	75 %	0 %	25 %	0 %	226526992
20	NC_012552	TCG	2	6	945	950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226526992
21	NC_012552	TGA	2	6	1017	1022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526992
22	NC_012552	CTT	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226526992
23	NC_012552	AAG	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526992
24	NC_012552	A	6	6	1219	1224	100 %	0 %	0 %	0 %	226526992
25	NC_012552	AGA	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526992
26	NC_012552	A	7	7	1243	1249	100 %	0 %	0 %	0 %	226526992
27	NC_012552	ATT	2	6	1267	1272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226526992
28	NC_012552	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226526992
29	NC_012552	TAA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226526992
30	NC_012552	TCAA	2	8	1491	1498	50 %	25 %	0 %	25 %	226526992
31	NC_012552	ATA	2	6	1502	1507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226526992
32	NC_012552	CAT	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226526992
33	NC_012552	TGAA	2	8	1549	1556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012552	GTA	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012552	AGAAA	2	10	1664	1673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012552	GCT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012552	GCG	2	6	1699	1704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012552	TAT	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012552	A	7	7	1752	1758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012552	AAGA	2	8	1781	1788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012552	TTG	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012552	TAG	2	6	1907	1912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012552	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
44	NC_012552	ATG	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526991
45	NC_012552	GAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
46	NC_012552	T	6	6	2150	2155	0 %	100 %	0 %	0 %	226526991
47	NC_012552	AGA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
48	NC_012552	TGAT	2	8	2370	2377	25 %	50 %	25 %	0 %	226526991
49	NC_012552	ATTT	2	8	2426	2433	25 %	75 %	0 %	0 %	226526991
50	NC_012552	GAAA	2	8	2516	2523	75 %	0 %	25 %	0 %	226526991
51	NC_012552	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526991
52	NC_012552	TAAAT	2	10	2638	2647	60 %	40 %	0 %	0 %	226526991
53	NC_012552	AT	3	6	2709	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	226526991
54	NC_012552	CAA	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226526991
55	NC_012552	AGA	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
56	NC_012552	AACA	2	8	2822	2829	75 %	0 %	0 %	25 %	226526991
57	NC_012552	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526991
58	NC_012552	AG	3	6	2848	2853	50 %	0 %	50 %	0 %	226526991
59	NC_012552	A	6	6	2876	2881	100 %	0 %	0 %	0 %	226526991
60	NC_012552	GAAA	2	8	2904	2911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012552	T	9	9	2962	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012552	AGTA	2	8	3000	3007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012552	G	6	6	3022	3027	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012552	TAC	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012552	AC	3	6	3037	3042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012552	C	6	6	3042	3047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_012552	GGT	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012552	T	6	6	3145	3150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012552	T	7	7	3185	3191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012552	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012552	T	6	6	3221	3226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012552	T	7	7	3241	3247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012552	A	6	6	3288	3293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012552	GAA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012552	TTC	2	6	3322	3327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012552	GGA	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012552	TTG	2	6	3368	3373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012552	A	6	6	3419	3424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012552	GGT	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012552	GGTA	2	8	3446	3453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.